Volume 1 (1893-1894): Epidemia de cólera no Rio de Janeiro e no Vale do Paraíba; tuberculose; febre amarela; reforma do Serviço Sanitário; qualidade das águas; Domingos José Freire Junior.
Volume 2 (1903-1904): Combate à febre amarela; varíola; regulamento sanitário federal.
Volume 3 (1904): Vacinação obrigatória contra a varíola e a campanha contra a sua regulamentação- Revolta da Vacina.
Volume 4 (1904-1906): Campanha de saneamento da cidade do Rio de Janeiro contra a febre amarela, peste bubônica e tuberculose; viagens de inspeção aos portos do Sul e Norte do Brasil.
Volume 5 (1906-1907): Saneamento das cidades; inspeção dos alimentos; peste bubônica na cidade do Rio de Janeiro; política no Rio de Janeiro; tuberculose; favelas; varíola.
Volume 6 (1907-1908): Peste bubônica; varíola; tuberculose.
Volume 8 (1911-1915): Febre amarela no Pará; Exposição de Higiene e Demografia de Dresden; epidemia de malária em São João Marcos; tuberculose; posse de Oswaldo Cruz na Academia Brasileira de Letras; saneamento da Amazônia; Conferência Sanitária Internacional realizada em Montevidéu; homenagem ao titular prestada pela Sociedade de Medicina e Cirurgia do Rio de Janeiro.
Volume 9 (1917): Morte de Oswaldo Cruz e as solenidades prestadas em sua homenagem.
Volume 10 (1903-1912): Caricaturas sobre a atuação de Oswaldo Cruz no comando da saúde pública.

Caderno de aula com anotações referentes a operações, farmácia, partos e clínica médica.

Trabalho realizado pelo titular enquanto diretor técnico do Instituto de Manguinhos. Em anexo quatro figuras feitas a partir de observações microscópicas e notas esparsas relativas ao estudo da peste, algumas apresentando os seguintes títulos: "septicemia", "vaccina anti-pestosa", "preparo de toxina pestosa por bacteriolyse".

Originais manuscritos do artigo apresentando as principais formas de contaminação dos meios de cultura por mucoríneas - que os torna inutilizáveis - e os procedimentos adequados para evitar tal contaminação, proporcionando assim um melhor aproveitamento de tais meios de cultura.

Originais manuscritos do artigo que considera aspectos referentes ao mecanismo de defesa do organismo vivo contra o micróbio invasor, indicando os cuidados e procedimentos que devem ser observados para que se realize o estudo da curva leucocitária. Publicado em "Brazil-Medico", v. 14, n. 10, p. 81-83.

Manuscrito do artigo publicado na revista "Brazil-Medico" em que o autor procura demonstrar que as más condições sanitárias do bairro da Gávea eram motivadas pelo aumento rápido da sua população, sem que os recursos higiênicos tenham aumentado proporcionalmente. O artigo ainda ocupa-se da identificação da origem de tal insalubridade e propõe medidas de saneamento para o referido bairro.

Caderno com anotações referentes ao curso ministrado pelo professor Francisco de Castro (Faculdade de Medicina do Rio de Janeiro). As notas foram colhidas à cabeceira dos doentes e coordenadas sob a forma de aforismos. Referem-se a moléstias de nutrição, moléstias microbianas e parasitárias, intoxicações, moléstias do sangue, moléstias do aparelho circulatório, moléstias do coração, lesões oro-valvulares, moléstia dos brônquios, moléstia dos pulmões e moléstias do aparelho digestivo.

Contém sete ilustrações feitas pelo titular, com suas respectivas legendas, sobre estruturas de mosquitos.

Organizado pelo titular em ordem alfabética sobre enfermidades, substâncias e procedimentos, contendo ao lado de cada nome ora a sua definição, ora os procedimentos terapêuticos, ora uma bibliografia correspondente.

Organizado pelo titular, em ordem alfabética, contendo uma lista de enfermidades e suas respectivas terapêuticas.

Caderno no qual Oswaldo Cruz faz anotações sobre experiências realizadas nos anos de 1916 e 1917.

Caderno de anotações de Oswaldo Cruz contendo aspectos a serem observados para proceder ao estudo dos alimentos.

Originais manuscritos do estudo crítico considerando a Tese de Doutoramento apresentada por José Gonçalves Roxo à Faculdade de Medicina do Rio de Janeiro. O texto analisa cada capítulo da tese em particular e conclui que o autor obteve êxito em seu empreendimento. Publicado no Annuario Medico Brazileiro, v.7, n.32/38.

Anotações correspondentes à realização de uma autópsia. Em anexo anotações sobre anatomia indicando limites e características das regiões occipito frontal, temporal, palpebral, superciliar, do nariz, parotidiana e labial.

Textos contendo instruções para a profilaxia da febre amarela e da peste.

Relação de endereços dos prédios onde ocorreram casos de peste bubônica entre 1900 e 1903; manuscrito da Sociedade de Salvação Pública na qual afirma-se a decisão de assassinar o titular, o prefeito do Distrito Federal, Francisco Pereira Passos e o presidente da República, Rodrigues Alves; lista das personalidades médicas e políticas contatadas durante a viagem de inspeção aos portos do Norte, realizada pelo titular em 1905.

Cartas e telegramas de pesar enviados por diversas personalidades e instituições à família do titular e ao Instituto Oswaldo Cruz; lista dos presentes à missa realizada na Igreja da Candelária.