Possui documentos que espelham boa parte da vida privada e trajetória profissional titular. Contém desde recibos de aluguel a nomeações para cargos que ocupou, livros caixa onde o titular anotava seu orçamento doméstico aos quais chamava de "Livro da Verdade". Neles também escrevia pensamentos, frases filosóficas e registrava datas importantes de sua vida.

O documento mais antigo deste conjunto é de autoria de Bento Gonçalves Cruz, pai do titular, versando sobre o saneamento da Lagoa Rodrigo de Freitas.

Texto de autoria do pai do titular, contendo considerações sobre as condições ambientais da Lagoa Rodrigo de Freitas. Realiza um retrospecto dos projetos de saneamento levados à administração pública e apresenta um planejamento que avalia como o mais adequado para a regiâo a supressão total da lagoa.

Possui 1.184 itens documentais divididos em três subséries. A Subsérie Pessoal, com 342 documentos, subdivididos em 12 dossiês, enviados pelo titular a sua esposa, como também aos filhos e entre estes personagens. A Subsérie Científica que está subdividida em 17 dossiês por missivas, possui 259 itens documentais. A Subsérie Político-Administrativa com 583 documenos subdivididos em 5 dossiês representados por cada um dos cadernos em que o titular deixava cópias de telegramas e cartas emitidos tanto a partir do IOC, da DGSP e da Prefeitura de Petrópolis.

Cartas enviadas pelo titular à sua esposa, Emília Fonseca, como também aos filhos e entre estes personagens.

Lista geral dos estudantes matriculados na Faculdade de Medicina do Rio de Janeiro em 1889; nomeação para a Santa Casa de Misericórdia; nomeação e exoneração da Diretoria Geral de Saúde Pública; nomeação para o cargo de auxiliar do Instituto Nacional de Higiene; convite oficial enviado pelo prefeito do Distrito Federal, Furquim Wernack, ao titular para compor o Conselho Municipal de Higiene e Assistência Pública; artigo sobre a carreira do titular publicado na revista Chanteclair; ofício enviado ao titular pela direção do Montepio da Fábrica de Fiação e Tecidos Corcovado aprovando a indicação de um substituto por ocasião de sua viagem de estudos à Europa.

Caderno de anotações onde Oswaldo Cruz discorre sobre experiências realizadas com microorganismos. Em anexo, uma folha com a medição da temperatura de um cavalo utilizado como cobaia para a experiência.

Cobre o período em que o titular ainda era estudante da Faculdade de Medicina do Rio de Janeiro, até o fim de sua vida.

Caderno de aula da terceira série do curso de medicina, realizado por Oswaldo Cruz na Faculdade de Medicina.

Caderno de aula do curso de medicina, realizado por Oswaldo Cruz na Faculdade de Medicina.

Caderno de aula utilizado por Oswaldo Cruz durante o curso de medicina, realizado na Faculdade de Medicina.

Está subdividida em 17 dossiês por missivistas. Correspondência trocada com Vital Brazil, onde descreve o início dos trabalhos em Manguinhos, as pesquisas sobre novos métodos de fabricação de soros, além do vasto conjunto epistolar trocado com Henrique da Rocha Lima, onde o titular vai noticiando as pesquisas realizadas em Manguinhos ao mesmo tempo em que estabelece as bases do intercâmbio entre esta instituição e as principais agências de pesquisa biomédica da Alemanha.

Caderno de aula de Oswaldo Cruz contendo anotações sobre os seguintes assuntos: anatomia topográfica, operações, partos, formas anômalas internas e externas e farmácia.

Caderno de aula com anotações referentes a operações, farmácia, partos e clínica médica.

Caderno com anotações referentes ao curso ministrado pelo professor Francisco de Castro (Faculdade de Medicina do Rio de Janeiro). As notas foram colhidas à cabeceira dos doentes e coordenadas sob a forma de aforismos. Referem-se a moléstias de nutrição, moléstias microbianas e parasitárias, intoxicações, moléstias do sangue, moléstias do aparelho circulatório, moléstias do coração, lesões oro-valvulares, moléstia dos brônquios, moléstia dos pulmões e moléstias do aparelho digestivo.

Texto original da tese apresentada à Faculdade de Medicina do Rio de Janeiro como trabalho de conclusão do curso. Tal trabalho encontra-se dividido em três partes: I - A água e os micróbios; II - Profilaxia contra a infecção pelas águas; III - Exposição dos processos de técnica empregados na realização das experiências. Na primeira parte estuda a biologia dos micróbios e discute a questão da veiculação das moléstias microbianas pelas águas; na segunda parte, os meios que a ciência ensina para que se evite a infecção pelas águas; e por último, uma breve exposição da técnica utilizada para a realização das experiências citadas ao longo deste trabalho. Ao final da tese, o titular produziu três proposições acerca de cada cadeira cursada na referida faculdade.

Originais manuscritos do estudo crítico considerando a Tese de Doutoramento apresentada por José Gonçalves Roxo à Faculdade de Medicina do Rio de Janeiro. O texto analisa cada capítulo da tese em particular e conclui que o autor obteve êxito em seu empreendimento. Publicado no Annuario Medico Brazileiro, v.7, n.32/38.

Caderno de experiências efetuadas por Oswaldo Cruz no Instituto Nacional de Higiene durante o ano de 1892, tais como: contagem de microorganismos contidos na água utilizada no laboratório do Instituto; contagem de micróbios acarretados no vapor d'água condensado na atmosfera do Instituto; inoculações dos micróbios do gelo em animais e lista bibliográfica a ser consultada.

É formada por dez cadernos com recortes de jornais e revistas, com datas-limite que vâo de 1893 a 1917. Estes cadernos possuem informações sobre a atuação política e científica de Oswaldo Cruz no comando da saúde pública na capital federal e no Instituto de Manguinhos.

Volume 1 (1893-1894): Epidemia de cólera no Rio de Janeiro e no Vale do Paraíba; tuberculose; febre amarela; reforma do Serviço Sanitário; qualidade das águas; Domingos José Freire Junior.
Volume 2 (1903-1904): Combate à febre amarela; varíola; regulamento sanitário federal.
Volume 3 (1904): Vacinação obrigatória contra a varíola e a campanha contra a sua regulamentação- Revolta da Vacina.
Volume 4 (1904-1906): Campanha de saneamento da cidade do Rio de Janeiro contra a febre amarela, peste bubônica e tuberculose; viagens de inspeção aos portos do Sul e Norte do Brasil.
Volume 5 (1906-1907): Saneamento das cidades; inspeção dos alimentos; peste bubônica na cidade do Rio de Janeiro; política no Rio de Janeiro; tuberculose; favelas; varíola.
Volume 6 (1907-1908): Peste bubônica; varíola; tuberculose.
Volume 8 (1911-1915): Febre amarela no Pará; Exposição de Higiene e Demografia de Dresden; epidemia de malária em São João Marcos; tuberculose; posse de Oswaldo Cruz na Academia Brasileira de Letras; saneamento da Amazônia; Conferência Sanitária Internacional realizada em Montevidéu; homenagem ao titular prestada pela Sociedade de Medicina e Cirurgia do Rio de Janeiro.
Volume 9 (1917): Morte de Oswaldo Cruz e as solenidades prestadas em sua homenagem.
Volume 10 (1903-1912): Caricaturas sobre a atuação de Oswaldo Cruz no comando da saúde pública.

Organizado pelo titular, em ordem alfabética, contendo uma lista de enfermidades e suas respectivas terapêuticas.

Cadernos de anotações- um deles intitulado "Livro da Verdade" contendo as receitas e despesas referentes a diversos anos compreendidos entre 1893 e 1916; recibos de pagamentos de aluguel efetuados pelo titular; documentos sobre a construção de dois prédios na praia de Botafogo, Rio de Janeiro; prestação de contas efetuadas pelo titular comprovando a utilização da quantia entregue pelo Ministério da Agricultura, Indústria e Comércio; recibo da inscrição do titular no 7º Congresso Brasileiro de Medicina e Cirurgia e seu testamento.

Certidões de batismo e casamento do titular; passagem ferroviária com destino a Santos e passaporte sanitário expedido pelo Serviço Sanitário de São Paulo por ocasião da comissão empreendida a Santos, onde grassava uma epidemia de peste bubônica.