Fundação Assistencial dos Servidores do Ministério da Fazenda (ASSEFAZ)
Fundação Brasileira para Conservação da Natureza
Fundação Caetano Munhoz da Rocha
Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ)
Fundação Centro Brasileiro para a Infância e Adolescência (FCBIA)
Fundação Centro de Formação do Servidor Público (FUNCEP)
Fundação Charlote Drake Cardeza
Fundação de Hematologia e Hemoterapia de Pernambuco (Hemope)
Fundação de Saúde do Estado da Bahia (FUSEB)
Fundação Educacional Lucas Machado (FELUMA)
Fundação Estadual de Engenharia do Meio Ambiente (FEEMA)
Fundação Estadual do Bem-Estar do Menor (FEBEM)
Fundação Ezequiel Dias (Funed)
Fundação Hospitalar do Distrito Federal (FNDF)
Fundação Joaquim Nabuco (Fundaj)
Fundação John Simon Guggenheim Memorial
Fundação Memorial da América Latina
Fundação Mineira de Educação e Cultura (Fumec)
Fundação Municipal de Saúde de Teresina (FMS)
Fundação Nacional de Ciência (Estados Unidos)
Fundação Nacional de Saúde (Funasa)
Surgiu da fusão de vários segmentos da área de saúde, entre os quais a Fundação Serviços de Saúde Pública (Fsesp) e a Superintendência de Campanhas de Saúde Pública (Sucam).
Fundação Nacional do Índio (Funai)