Considerada a primeira escola de ensino médico do país, foi criada em fevereiro de 1808, por ocasião da vinda do Príncipe-Regente D.João e da Corte Portuguesa para o Brasil. Inicialmente ficou sediada no Hospital Real Militar, localizado no antigo prédio do Colégio de Jesuítas. Mais tarde, funcionou também nas dependências da Santa Casa da Misericórdia da Bahia. Devido ao incêndio de 1905 que atingiu parte de suas dependências, essas sofreram reformas e ampliações. Desde 1946, tornou-se uma unidade da Universidade da Bahia, que a partir de 1965, recebeu o nome de Universidade Federal da Bahia.

Criada em março de 1911, por iniciativa de membros da Sociedade Médico-Cirúrgica de Minas Gerais, funcionando inicialmente no Palacete Thibau, à Avenida Afonso Pena, na cidade de Belo Horizonte (MG). Em 1927, tornou-se uma das unidades da Universidade de Minas Gerais, mantida pelo governo estadual até 1949, quando foi federalizada. Em 1965, passou a integrar a Universidade Federal de Minas Gerais.

Originou-se da Escola Livre de Farmácia e Química Industrial de Porto Alegre, criada em fevereiro de 1896 por iniciativa dos membros da União Farmacêutica de Porto Alegre, entrou em funcionamento no ano seguinte, instalando-se na Escola Normal. Ainda em 1897, foi criado um curso de partos que era ministrado na Santa Casa da Misericórdia da capital gaúcha. A partir da junção dos cursos de farmácia, química industrial e de partos teve origem a Faculdade de Medicina e Farmácia de Porto Alegre em 25 de julho de 1898. No ano seguinte iniciou suas atividades. Embora tenha retirado a Farmácia de sua denominação em 1911, a Escola de Farmácia foi mantida como anexa à Faculdade de Medicina, tornando-se autônoma somente a partir de dezembro de 1949. Pelo decreto nº 20.530 de 17/10/1931, a faculdade tornou-se um instituto federal. Com a criação da Universidade de Porto Alegre foi autorizada a integração da Faculdade de Medicina, com suas escolas de Odontologia e Farmácia, à quela Universidade pela lei nº 173 de 06/01/1936. A partir de então, passou a se chamar Faculdade de Medicina da Universidade de Porto Alegre. Em 1949, os cursos de odontologia e farmácia foram transformados em institutos autônomos. Em 1965, todas as universidades vinculadas ao Ministério da Educação e Cultura foram qualificadas de federais. Dessa forma, a instituição aqui recebeu o nome de Faculdade de Medicina da Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Criada a partir de decisão da Congregação da Escola de Farmácia de Pernambuco no ano de 1914, entrando em funcionamento somente em julho de 1920. Inicialmente, ficou instalada na Escola Manuel Borba, sendo transferida em 1927 para sede própria. A partir da reforma de ensino Rocha Vaz, em 1925, foi oficializada a junção das escolas de farmácia e odontologia, que tornaram-se faculdades anexas à Faculdade de Medicina. Em 1958, tornou-se uma das unidades da Universidade do Recife, depois Universidade Federal de Pernambuco.

O marco da criação da Escola Anatômica, Cirúrgica e Médica do Rio de Janeiro é a nomeação do cirurgião Joaquim da Rocha Mazarém para a cadeira de anatomia, em 2 de abril de 1808. Funcionou inicialmente nas dependências do Hospital Real Militar, antigo Colégio dos Jesuítas, no morro do Castelo, transferindo-se depois para dependências da Santa Casa da Misericórdia do Rio de Janeiro, na praia de Santa Luzia. Considerada a segunda escola de ensino médico no país, somente em 1918, ganhou sede própria construída na Praia Vermelha, onde permaneceu até o ano de 1973, quando foi transferida para o campus universitário na Ilha do Fundão. Em 1920 passou a integrar a Universidade do Rio de Janeiro, transformada em Universidade do Brasil em 1937. A partir de 1965, tornou-se uma unidade da Universidade Federal do Rio de Janeiro.