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Criada no dia 10 de abril de 1912, como Faculdade de Medicina Homeopática do Rio de Janeiro . Alguns dos seus fundadores eram membros do Instituto Hahnemanniano do Brasil. Neste mesmo ano, foi extinta sendo recriada com o nome de Faculdade Hahnemanniana a partir de proposta apresentada pelo presidente do Instituto, Licínio Cardoso. Tendo por fim ministrar o ensino da medicina homeopática, diplomando médicos e farmacêuticos. Utilizou para o ensino prático hospitais mantidos pela Santa Casa da Misericórdia do Rio de Janeiro. Adotou a denominação Escola de Medicina e Cirurgia em 1924.

Em dezembro de 1948, o Instituto Hahnemanniano desvinculou-se de sua faculdade de medicina homeopática, criada em 1912, concedendo-lhe autonomia, quando então essa passou a denominar-se Escola de Medicina e Cirurgia do Rio de Janeiro. Organizada como sociedade civil, teve seu estatuto aprovado em 1949 e homologado pelo Ministério da Educação e Saúde no dia 28 de abril de 1950. Pela Lei número 1.398, de 1951, parte do patrimônio do Instituto foi transferido para a Escola. Pelo decreto n°3.271 de 30 de setembro de 1957, a Escola foi federalizada, ficando subordinada ao Ministério da Educação e Cultura. Tornou-se, então, uma faculdade de medicina alopática, ministrando algumas cadeiras eletivas de homeopatia. Em 1966 conseguiu do Governo Federal a incorporação do Hospital Gaffrée e Guinle. Três anos mais tarde, a Escola de Medicina e Cirurgia do Rio de Janeiro foi incorporada à nova entidade criada pelo Governo Federal, a Federação das Escolas Federais Isoladas do Estado da Guanabara (FEFIEG), que em 1975, passou a ser denominada de Federação das Escolas Federais Isoladas do Estado do Rio de Janeiro, devido à fusão do Estado da Guanabara com o antigo Estado do Rio de Janeiro. A partir de 1979, passou a denominar-se de Escola de Medicina e Cirurgia da Universidade do Rio de Janeiro.

Foi inaugurado em 1938 como Sanatório Getúlio Vargas. Posteriormente, foi transformado em Hospital das Clínicas para servir de campo de estágio ao ser criado o curso de Medicina da Universidade Federal do Espírito Santo, em 20 de dezembro de 1967. Em 1980 adotou o nome atual.

Fundada como Sociedade Brasileira de Ciências no dia 3 de maio de 1916, no salão nobre da Escola Politécnica do Rio de Janeiro. A iniciativa de sua criação partiu de alguns dos professores dessa Escola, onde ficou inicialmente instalada. Neste local, reuniam-se periodicamente esses professores, assim como pesquisadores do Observatório Nacional, do Museu Nacional e do IOC, recebendo adesão também do Serviço Geológico e Mineralógico do Brasil. O objetivo de promover a ciência pura e desinteressada foi uma característica marcante em toda a primeira fase da Sociedade. Seu primeiro presidente foi Henrique Charles Morize. A partir de 1921 passou a denominar-se Academia Brasileira de Ciências.