O departamento atua trabalha em parceria com instituições nacionais e internacionais de excelência no campo da investigação científica e com os organismos responsáveis pela assistência à saúde e à prevenção de doenças no Brasil. Sua atuação na produção e disseminação de conhecimentos inclui temas como o estado de saúde da população e dos seus subgrupos, os determinantes da saúde e da doença, o desenvolvimento dos métodos e das técnicas epidemiológicas e estatísticas e suas múltiplas aplicações em saúde pública, a avaliação dos programas, dos serviços e das tecnologias em saúde, a formulação de políticas e de propostas para o sistema de saúde. Também busca contribuir para o desenvolvimento de maior capacidade analítica e operacional dos gestores e dos prestadores de serviços do SUS, através da produção e da difusão de métodos, técnicas e instrumentos destinados à melhoria da qualidade da atenção a saúde. Promove intercâmbio e colaboração junto a instituições e profissionais, nacionais e internacionais com quem compartilhamos os mesmos fins. Por fim, busca divulgar amplamente para a população os resultados mais relevantes das investigações científicas.