Documentos textuais: reúne documentos que abordam a origem do IOC, fornecendo informações sobre sua criação e funcionamento, e sobre as atividades de pesquisa, ensino, produção e assistência, nas áreas de ciências biomédicas e saúde pública desenvolvidas ao longo do século XX. Abrange, por exemplo, documentos relacionados à administração de pessoal e gestão institucional, em que se destacam: relatórios anuais de atividades; correspondência da Direção (1908-1971); livros e dossiês com assentamentos funcionais; documentos relativos aos concursos públicos para o provimento de cargos de assistente (1917) e chefe de laboratório (1936), bem como o funcionamento dos órgãos subordinados ao IOC e localizados em outras unidades da federação, entre os quais o Hospital Regional de Lassance (MG, 1911-1941), o Instituto de Patologia Experimental do Norte (PA, 1936-1941) e o Instituto Ezequiel Dias (BH, 1936-1941). Inclui ainda documentos sobre o funcionamento e manutenção das instalações do IOC na Ilha dos Pinheiros, na Baía de Guanabara. Destacam-se também relatórios e ordens de serviço referentes à administração de biotérios e à manutenção da segurança do campus de Manguinhos. Sobre os serviços destacam-se laudos de análise de medicamentos; guias de controle da distribuição de penicilina e boletins de exame de ratos (1944-1957), da Divisão de Microbiologia e Imunologia, atividade desenvolvida em parceria com o Serviço Nacional da Peste. Entre os documentos produzidos e acumulados pelos departamentos e laboratórios que desenvolvem atividades de pesquisa encontram-se relatórios e protocolos de experiências, cadernos de protocolo, cadernos de campo e de laboratório, cadernos de necropsias, artigos científicos, cartas, formulários com resultados de exames, exames diagnósticos e livros de registro, entre outros. Quanto aos serviços de assistência médica destacam-se os documentos do Hospital Evandro Chagas, como prontuários médicos de portadores de doença de Chagas. Sobre as atividades de ensino desenvolvidas no IOC os documentos refletem aspectos da administração acadêmica da Coordenação dos Cursos desenvolvidos desde a década de 1910 (1908-1969) e do Curso Especializado de Higiene e Saúde Pública.
Documentos iconográficos: reúne fotografias que retratam as atividades desenvolvidas pelo IOC (1873-1980) desde sua criação, como a construção de seus pavilhões; aspectos gerais do campus e arredores; principais personagens, entre eles pesquisadores, técnicos, alunos e funcionários; expedições científicas e material coletado; campanhas sanitárias; visitantes ilustres; aspectos técnicos
e científicos das pesquisas; produção de imunobiológicos e de fármacos; pacientes e eventos. Inclui também imagens da atuação de Oswaldo Cruz e Carlos Chagas e de diplomas, condecorações, títulos e registros de participação em sociedades científicas. O fundo contém esboço do futuro Pavilhão Mourisco feito por Oswaldo Cruz, desenhos com detalhes das edificações do IOC, do Pavilhão da Exposição de Dresden, da descrição morfológica de insetos e helmintos pertencentes à documentação produzida e acumulada no âmbito das coleções científicas de entomologia e helmintologia, além de cartazes de eventos científicos, de cursos e das Memórias do Instituto Oswaldo Cruz.
Documentos cartográficos: reúne mapas de vários estados brasileiros com representações de registros epidemiológicos, indicando áreas de incidência da febre amarela, e plantas com perspectiva geral e detalhes de fachadas e pavimentos das construções dos primeiros pavilhões e do edifício principal do conjunto histórico do IOC. Inclui também levantamentos topográficos da área; planta da residência de Oswaldo Cruz no bairro de Botafogo; plantas da fazenda Manguinhos e do campus da Fiocruz (1903-1932).
Documentos sonoros: reúne registro dos discursos da cerimônia de posse da diretoria do IOC em 28 de abril de 1989.
Documentos audiovisuais: reúne filmes produzidos em 1911. O primeiro, intitulado Chagas em Lassance, mostra Carlos Chagas e doentes estudados por ele em Lassance (MG), região onde, em 1909, foi descoberta a doença que leva seu nome. Provavelmente Carlos Chagas exibiu esse filme nas suas aulas e também na Academia Nacional de Medicina. O segundo filme, Serviço de Febre Amarela, apresenta imagens do Serviço de Profilaxia da Febre Amarela, da ação dos guardas sanitários no combate ao mosquito transmissor e das diversas técnicas de desinfecção das casas, da cobertura das casas com pano americano, do isolamento dos doentes, do aparelho Clayton, e do nascimento do mosquito Aedes aegypti. Os filmes foram apresentados por Oswaldo Cruz na Exposição Internacional de Higiene, realizada em 1911 em Dresden, Alemanha.

Documentos textuais: reúne ofícios, telegramas, programas e projetos de pesquisa, fichas de dados epidemiológicos e de levantamento parasitológico e helmintológico, relatórios de atividades, inquéritos sorológicos, artigos científicos, boletins informativos e recortes de jornais, entre outros documentos, referentes às atividades de ampliação do conhecimento no campo de endemias rurais, de aperfeiçoamento de seus métodos profiláticos, além das atividades destinadas a combatê-las, que eram desenvolvidas pelas circunscrições nos estados e municípios. Inclui também organogramas, boletins semanais, portarias, declarações, ofícios-circulares, planos de trabalho, termos de acordos e convênios, entre outros documentos, referentes às atividades de administração interna do INERu, bem como aquelas resultantes de suas relações com outras instâncias político-administrativas em sua condição de órgão do DNERu do Ministério da Saúde.
Documentos iconográficos: reúne fotografias das sedes dos centros de pesquisa construídos para atender ao desenvolvimento de programas, projetos e planos de pesquisas locais, como também das localidades que serviram como estudo de campo para pesquisas, seja pela coleta de animais, seja pelo alto grau de infecção entre seus habitantes, de pessoal treinado para atuar em tais pesquisas,
de laboratórios, postos médicos e também de construções de cunho profilático. Grande parte das fotografias apresenta-se colada a páginas de relatórios, alguns destes relativos às atividades geradas com base em convênios estabelecidos entre o INERu e instituições como a Organização Pan-Americana da Saúde, a Fundação Rockefeller, a Superintendência de Desenvolvimento do Nordeste, a United States Assistance for International Development e o Instituto Pasteur. É importante ressaltar que essas fotografias não abrangem todo o período de atuação do instituto, pois apresentam sua produção localizada entre 1951 e a década de 1970. Observa-se, também, que a maior parte das fotografias foi produzida enquanto o INERu esteve sob a direção de José Rodrigues da Silva.

Reúne prontuários médicos, eletroencefalogramas, exames, laudos médicos, fichas de anestesia, autópsias, censo diário, censo hospitalar, cadernos de anotação, registro de admissões e altas, estatísticas, mapas de produção, entrevistas, movimento diário, inscrição de estagiários, relatórios e projetos de pesquisa. Inclui ainda documentos referentes à administração institucional, como folhas de frequência, cartões de ponto, livros de ponto, lotação de pessoal admitido, controle de expediente, guias de remessa, pedidos de material, notas fiscais e de empenho, agendas, livros de registro e de protocolo, declarações e cartas-convite.

Reúne cartas, certificados, diplomas, recortes de jornais, artigos científicos, publicações e ensaios, entre outros documentos referentes à trajetória profissional do titular como pesquisador de instituições científicas nacionais e internacionais.

Reúne cartas, ofícios, memorandos, telegramas, folhetos, relatórios de atividades, fotografias, diapositivos, currículos, certificados, diplomas, artigos científicos, publicações, informativos, programas de eventos, conferências, cartazes, recortes de jornais e revistas, plantas e comunicações em eventos, entre outros documentos referentes à vida pessoal e à trajetória profissional da titular na área de educação em saúde no Brasil e exterior.

Reúne cartas, telegramas, ofícios, memorandos, diplomas, recortes de jornais, fotografias, discursos, relatórios de atividades, comunicações em eventos, informativos, artigos científicos, atas de reuniões, plantas, pautas de reuniões e prospectos, entre outros documentos referentes à vida pessoal e à trajetória profissional do titular como médico, professor e gestor nas áreas de hematologia e hemoterapia.

Reúne cartas, artigos científicos, projetos, manuais, relatórios, recortes de jornais, fotografias e videodocumentários, entre outros documentos referentes à vida pessoal e à trajetória profissional do titular como sanitarista, professor, pesquisador e gestor de instituições de ensino, saúde pública e previdência social.

Reúne agendas, artigos científicos, cadernos de apontamentos, cartas, cartões-postais, cartões de visita, certificados, convites, currículo, diários, diplomas, portarias, relatórios de atividades, diplomas, recortes de jornais e revistas, informativos, entrevistas, livros de protocolo e registro, memorial descritivo, projetos de pesquisa e fotografias, entre outros documentos referentes à vida pessoal e à trajetória profissional do titular como pesquisador, gestor de laboratórios, departamento, comissões e presidente da Fundação Oswaldo Cruz.

Reúne cartas, memorandos, ofícios, artigos científicos, discursos, fotografias, desenhos, estudos de caso, cartões-postais, cédulas de identidade, passaportes, relatórios de atividades, certificados, declarações, programas de eventos, negativos de vidro, apostilas de curso, informativos, diapositivos, ensaios, crachás, recortes de jornal e revistas, entre outros documentos referentes à vida pessoal e à trajetória profissional do titular como pesquisador, professor, gestor e membro de instituições e associações científicas, tanto no Brasil como no exterior.

Reúne cartas, telegramas, cartões-postais, memorandos, ofícios, fotografias, diapositivos, artigos científicos, ensaios, discursos, diplomas, certificados, recortes de jornais, informativos, cadernos de protocolo de pesquisa e relatórios de atividades, entre outros documentos referentes à vida pessoal e à trajetória profissional do titular como professor e pesquisador nas áreas de fisiologia e farmacologia no Instituto Oswaldo Cruz e na Universidade Centro-Ocidental Lisandro Alvarado.

Reúne cartas, telegramas, fotografias, recortes de jornais e revistas, resoluções e Diário Oficial referentes à vida pessoal e à trajetória profissional do titular como psiquiatra, membro da Academia Nacional de Medicina e diretor da Colônia de Alienadas do Engenho de Dentro e da Assistência a Psicopatas.

Reúne cartas, memorandos, atas, balancetes, projetos, manuais, orçamentos, emendas, portarias, fotografias, editais, boletins, recortes de jornais, organogramas, regimentos, normas, relatórios, convênios e contratos, entre outros documentos referentes às atividades do SESP e da FSESP, tais como: finanças, material e patrimônio, trabalhos apresentados em congressos, seminários e simpósios, formação e aperfeiçoamento de pessoal, cursos, treinamentos e estágios, programas de educação sanitária, tratamento e controle de doenças, construção de unidades de saúde, assistência hospitalar em geral, assistência odontológica e saneamento básico, com abastecimento de água, esgoto sanitário e controle ambiental.

Reúne fotografias referentes às ações empreendidas pela Fundação Rockefeller no Brasil, com ênfase no Rio de Janeiro, Bahia e Ceará e, em menor medida, na América Latina. Registram desde as pesquisas científicas, o processo de fabricação de vacina antiamarílica e os serviços de combate à febre amarela e à malária, até aspectos das regiões do país onde a instituição atuou.

Reúne cartas, relatórios de atividades, diários, resumos, textos e artigos científicos, entre outros documentos referentes às atividades da instituição no combate e profilaxia da malária e da febre amarela no Brasil, além de outras iniciativas no campo da saúde pública.

Reúne cartas, ofícios, memorandos, circulares, telegramas, portarias, recortes de jornais, recibos de pagamento, artigos científicos, currículos, planos de aula, certificados e programas de eventos, declarações, fotografias, projetos, propostas, relatórios e textos de pesquisas, entre outros documentos referentes à vida pessoal e à trajetória profissional do titular como professor, pesquisador e gestor da área de saúde pública.

Reúne cartas, ofícios, diplomas, relatórios de atividades, artigos científicos, comunicações em eventos, recortes de jornais e revistas, designações e fotografias, entre outros documentos referentes à trajetória profissional do titular na área da pesquisa em doença de Chagas.

Reúne fotografias referentes à trajetória do titular como pesquisador do Instituto Oswaldo Cruz, coordenador do Programa de Erradicação da Bouba, chefe do gabinete do Ministério da Saúde, bem como outras atividades profissionais e homenagens a ele conferidas.

Reúne documentos produzidos e acumulados por Oswaldo Gonçalves Cruz, seus filhos Hercília Oswaldo Cruz e Oswaldo Cruz Filho, e seu neto Eduardo Oswaldo Cruz.

Reúne cartas, telegramas, circulares, ofícios, memorandos, diários, relatórios, decretos, artigos científicos, textos de pesquisa, teses, álbuns de recortes de jornais, fotografias, listas de controle de animais, fichas de exame anatomopatológicos, protocolos de necropsia, planos de combate de endemias, balanços, recibos de pagamento, designações, plantas e mapas, entre outros documentos referentes à vida pessoal e à trajetória profissional do titular como pesquisador e formulador de políticas de combate às grandes endemias nacionais.

Reúne cartas, cartões-postais, telegramas, recortes de jornais, fotografias, desenhos, discursos, artigos científicos, publicações, discursos e ensaios, entre outros documentos referentes à vida pessoal e à trajetória profissional do titular como pesquisador, professor e diretor de cursos sobre saúde pública, com ênfase no estudo, combate e controle da doença de Chagas no Brasil.

Reúne fotografias, diapositivos, imagens impressas, negativos flexíveis e mapas referentes à vida pessoal e à trajetória profissional do titular como pesquisador e gestor no Instituto Oswaldo Cruz e na Fiocruz.

Documentos textuais: reúne documentos relativos às principais atividades desenvolvidas pela ENSP, como o ensino e a pesquisa, além de sua organização e funcionamento, tanto no que diz respeito às suas principais instâncias decisórias, como conselhos, coordenações de áreas, quanto a aspectos técnico-acadêmicos e à administração geral. No que se refere a ensino e pesquisa, destacam-se os materiais referentes ao planejamento e ao funcionamento dos cursos de saúde pública em níveis de aperfeiçoamento (Curso Básico de Saúde Pública) e pós-graduação lato sensu (especialização em saúde pública) e pós-graduação stricto sensu (mestrado e doutorado em saúde pública) e cursos regionalizados e descentralizados de saúde pública, como programas, relatórios de avaliação, mapas de controle de programas, quadros de horários, normas de mensuração e eficiência, relação de alunos, provas e textos. Inclui documentos relativos a formulação, desenvolvimento e avaliação de convênios, programas e projetos voltados às áreas de ensino, pesquisa e prestação de serviços em saúde pública, em muitos casos resultantes da cooperação com instituições brasileiras e com organismos internacionais. Os documentos contemplam também a realização de eventos científicoacadêmicos ou de discussão de políticas públicas, incluindo a sua programação, os trabalhos apresentados e seus documentos finais. Dentre os registros que permitem um detalhamento das atividades finalísticas desenvolvidas pela ENSP, destacam-se textos, apostilas e outros materiais utilizados para fins didáticos ou como suporte à pesquisa, artigos, relatórios setoriais e de projetos de pesquisa, avaliações epidemiológicas, programas de atividades, planos de ação, material didático elaborado para treinamento, livros de atas e relatórios das principais instâncias colegiadas, assim como a correspondência emitida e recebida pela diretoria da unidade e pelos seus departamentos. A área de administração geral da unidade é contemplada, de forma abrangente, por documentos referentes a assuntos de pessoal, à aquisição e ao controle de materiais e equipamentos e, em menor escala, ao planejamento orçamentário e ao acompanhamento contábil.
Documentos iconográficos: reúne fotografias situadas entre as décadas de 1960 e 1980, que retratam o prédio e as instalações da ENSP; eventos, como a IV Conferência Nacional de Saúde; cursos oferecidos pela instituição, tais como o Curso Básico Regionalizado de Saúde Pública e o de Odontologia Social; campanhas de vacinação e outras ações realizadas no Brasil e na África pelo Programa Ampliado de Imunizações. Inclui ainda cartazes educativos do Ministério da Saúde sobre campanhas de vacinação, saúde, desenvolvimento dos povos indígenas e utilização de medicamentos, entre outros. Documentos cartográficos: reúne plantas arquitetônicas do prédio sede da ENSP.
Documentos sonoros: reúne depoimentos orais produzidos entre 1985 e 1993 no âmbito de quatro projetos de pesquisa: História e saúde pública: a política de controle do câncer no Brasil; Reviravolta na saúde: origem e articulação do movimento sanitário; Ações integradas de saúde (AIS). Estudo de caso: estado do Rio de Janeiro; Programa Nacional de Imunizações. Possui também discos sonoros produzidos pelo Ministério da Saúde referentes às campanhas de controle de doenças e vacinação.
Documentos audiovisuais: reúne filmes cujas temáticas envolvem as condições sanitárias das populações da Amazônia e as principais doenças encontradas nessa região, como malária, hanseníase, leishmaniose e hepatite fulminante – conhecida como peste negra. Esses filmes foram produzidos pela ENSP em parceria com a Organização Pan-Americana da Saúde e o Smithsonian Institute Center for Folklife Programs Cultural Studies.

Reúne cartas, telegramas, jornais, noticiários, fotografias, memoriais, discursos, informativos, revistas e recortes de jornais, entre outros documentos referentes à vida pessoal e à trajetória profissional do titular como professor, pesquisador, dirigente e membro de instituições e associações científicas e acadêmicas.

Reúne artigos científicos, cartões, cartas, recortes de jornais, ensaios, noticiários, dissertações, publicações ("Espaço & Debate", "Vidas em risco", "Brazil: war on children", "Children without a future", "Medio ambiente y urbanizacion", "Cadernos da Cidade", "Shantytown protest in Pinochet's Chile", "The Latin American city", "Nuevas políticas urbanas: las ONG y los gobiernos municipales en la democratización latinoamericana"), revistas, prospectos, revista CEAP, estatutos, informativos, projetos, teses, entrevistas, mensagens por e-mail, cartazes, jornais, relatórios de atividades e bilhetes referentes à trajetória profissional da titular no campo das ciências sociais.

Reúne cartas, memorandos, ofícios, artigos científicos, discursos, fotografias, estudos de caso, cartões-postais, trabalhos escolares, relatórios de atividades, certificados, declarações, projetos de pesquisa, programas de eventos, apostilas de curso, informativos, mensagens por fax, diapositivos, ensaios, cartazes, recortes de jornais e revistas, entre outros documentos referentes à vida pessoal e à trajetória profissional do titular como professor, pesquisador, dirigente e membro de instituições científicas e político-partidárias no Brasil.

Reúne cartas, ofícios, aerogramas, artigos científicos, currículos, certificados, portarias, mensagens por e-mail, diplomas, certificados, programas de eventos, recortes de jornais e revistas, projetos, fotografias, desenhos, diapositivos e comunicações em eventos, entre outros documentos referentes à vida pessoal e à trajetória profissional da titular como pesquisadora do Instituto Oswaldo Cruz nas áreas de anatomia e histologia de insetos e cracas.

Reúne documentos de gêneros distintos referentes ao questionamento sobre a obrigatoriedade de vacinação por parte de positivistas, ao comércio médico e cirúrgico argentino, à Associação Brasileira de Ensino Médico, a instrumentos do Observatório Nacional, à propaganda sobre malária, a eventos no Instituto Oswaldo Cruz, entre outros assuntos.